Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CBFBQ13951 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms