Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 C2CD5-218ENST00000545552 3471 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC079768.1-201ENST00000503181 711 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC068134.3-201ENST00000513620 788 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 RN7SL473P-201ENST00000580341 299 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 TP63-201ENST00000264731 4909 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 NUDT13-203ENST00000372997 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CAMK2BQ13554 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms