Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
SF3B2Q13435 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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