Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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SGCGQ13326 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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SGCGQ13326 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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SGCGQ13326 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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SGCGQ13326 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SGCGQ13326 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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