Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
DUSP4Q13115 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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