Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TTPAP49638 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TTPAP49638 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TTPAP49638 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms