Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ERVV-2B6SEH9 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms