Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms