Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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