Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms