Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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ZNF548Q8NEK5 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ZNF548Q8NEK5 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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