Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms