Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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