Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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