Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms