Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
GTF2H3Q13889 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms