Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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