Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CACNB4-270ENST00000638040 2026 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC138811.1-201ENST00000569096 361 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
MKRN3Q13064 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
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