Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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