Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SEMA4CQ9C0C4 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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