Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
NEDD1Q8NHV4 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.7 ms