Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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VAMP3Q15836 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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