Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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HMGN3Q15651 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HMGN3Q15651 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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