Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMCO1Q147U7 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms