Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms