Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
ITGB3BPQ13352 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms