Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHAF1BQ13112 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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