Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TRAF1Q13077 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TRAF1Q13077 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAF1Q13077 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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