Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
GRIK2Q13002 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.1 ms