Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPN13Q12923 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PTPN13Q12923 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PTPN13Q12923 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PTPN13Q12923 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PTPN13Q12923 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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PTPN13Q12923 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PTPN13Q12923 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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