Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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HOXD12P35452 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD12P35452 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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