Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRMP28827 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTPRMP28827 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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