Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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