Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
C4BP0C0L5 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C4BP0C0L5 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms