Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
HOXA2O43364 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms