Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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EHD3Q9NZN3 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EHD3Q9NZN3 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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