Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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