Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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FOXQ1Q9C009 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FOXQ1Q9C009 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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