Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
COL24A1Q17RW2 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms