Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPRRQ15256 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPRRQ15256 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPRRQ15256 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PTPRRQ15256 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PTPRRQ15256 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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