Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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TRAM2Q15035 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TRAM2Q15035 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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