Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
R3HDM1Q15032 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
R3HDM1Q15032 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms