Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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CDH18Q13634 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CDH18Q13634 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CDH18Q13634 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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