Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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SP140Q13342 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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SP140Q13342 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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SP140Q13342 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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SP140Q13342 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SP140Q13342 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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