Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 GAPVD1-201ENST00000265956 2667 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CLN3Q13286 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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