Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SREBF2Q12772 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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