Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms