Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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