Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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