Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA5P20719 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms